坚定人们的科学信念，树立人们的科学精神是科普工作的一个重要环节。上海科技出版人正是在此认识之上，将科学思想和科学方法的普及作为他们出版业的重中之重。
上海科学普及出版社自上半年起，就本着“大科普”的观念，特别关注科学思想和科学方法在科普工作中的重要作用，他们侧重于技术运用方面的选题，从中总结方法，将科普书的出版重点从知识类转向传播科学思想、方法和观念类。《科学思想和科学方法》一书的出版就是对该社出版计划的最好说明。该书从马克思主义唯物论、知识经济、技术创新经济学和人类生态学的角度，重点介绍了作为现代科技意识核心内容的科教兴国思想和可持续发展思想，从辩证唯物主义、科学哲学和科学社会学的角度介绍了求实、求真、理性和创新等科学精神的主要内容。还重点介绍了科学的调查研究、方案制定、决策和管理方法以及作为创新活动基础之一的科学思维方法。同时该社较注意培养读者的实际应用能力，如《怎样用Internet打电话》、《跟我上网》等是该社出版工作的又一个闪亮点。下一步该社准备将科普出版的重点定位在干部读物，对少年儿童则重点进行科学思想和方法的初级普及，并对广大农民急需的实用农技类图书和职业技术培训用书进行大力开发，以此为全民素质的提高尽一份心力。
上海科学技术文献出版社长期以来为普及医药卫生知识，出版了一大批医疗保健图书。包括《家庭卫生保健万宝丛书》、《家庭医学百科》、“百病防治丛书”、《中华自然疗法》、《食粥与养生》等书及多种气功养生保健图书，如《中华气功导引养生宝典》、《气功导引祛病健身法》、《推拿功法与治病》等。这些书都一再重印、再版，有的发行逾百万册，产生了良好的社会效益与经济效益，并形成了该社的一大特色，该社的《智慧百花园》与“科学攀登丛书”（即将出版）则从知识与方法的双重角度探讨科普作品的新视点。值得指出的是，该社出这类书时，始终坚持把社会效益放在第一位，坚决反对封建迷信、反对伪科学，对诸如占卜、星相、算命等宣传迷信的文化垃圾，获利再丰厚，也一概拒之门外。
上海科技教育出版社在对待科学思想和方法的普及上有自己独到的见解，他们认为从科学史中能够总结出科学方法、科学思想的特征和规律，然而有争议的新的科学发展也能体现科学新思维的新方法。在某种程度上，后者更能训练人的思维，所以该社计划加大力度出版一些关于科技发展前沿的图书，以此开拓读者的科学视野。除了“哲人石丛书”（当代科普名著系列、当代科学家传记系列、当代科学思潮系列）外，《世界科技英才录》就是严格按照科学精神卷、科学思想卷、科学方法卷和科学发明卷来组织题材的。最新出版的《名家讲演录》12种则收录了著名学者的专题讲演。该社在推崇方法和技巧的同时，并不否认科学知识的重要作用，他们认为理论上的塑造和教化要附之以实践的证实，所以出版了一些实用性较强的图书，如一元一册的《科教活页文选》系列丛书、“健康速递丛书”等，包括医药保健、天文地理等方面的知识，并力求达到以科学事实说话，以科学理论服人的目的。
上海科学技术出版社认为科学知识和方法的普及本应双管齐下，不应偏颇任何一方，在目前阶段，知识性科普主要面对低幼儿童，而方法的普及则面向全社会。针对现代人特别注重创新精神，他们选择一些有自己写作风格的大师的作品来拓宽人们的思维空间，培养人们的思辨能力。该社已经签约的《view》和正在陆续出版的《科学大师佳作系列》等都是从这一方面入手的。另外，他们还计划组织国内一批骨干力量，出版一些文理兼容的结合中国实际的科普图书，以弘扬国人的科学精神。
在科普工作的进程中，上海科技出版人逐步摸索其切实可行的新路子，体现了上海人的创新精神；从科学方法和科学知识的综合角度去培养人的科学精神，展示了上海人兢兢业业抓工作的干劲；对伪科学图书的拒斥和对科学前沿知识的宣传，又表现了上海人的科学素养。相信在引导人们全面认识科学，树立正确科学世界观，弘扬科学精神方面，上海科技出版人将会继续起到其龙头作用。
